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Las células T auxiliares sólo reconocen al antígeno en el enlace de los marcadores CMH Clase I. Aquí una célula T citotóxica en reposo reconoce a los fragmentos de virus, los cuales son desplegados por un macrófago en combinación con un marcador CMH Clase I. Un receptor en una célula T citotóxica en reposo, circulando (y proteína CD8) reconoce al complejo antígeno-proteína y se enlaza a él. El proceso de enlace y una célula T activada auxiliar activa a la célula T citotóxica. Debido a que las superficies de otras células infectadas exhiben los mismos fragmentos de virus en combinación con los marcadores CMH Clase I, las células T citotóxicas activadas pueden rápidamente reconocer, atacar y destruir a la célula enferma.
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