Los órganos de su sistema inmunológico se encuentran localizados por todo su cuerpo.

Se les conoce como órganos linfoides debido a que son el sitio de origen de los linfocitos-los glóbulos blancos que constituyen los agentes clave del sistema inmunológico. Dentro de estos órganos es donde los linfocitos crecen, se desarrollan y se despliegan.

La médula ósea, el tejido suave localizado en el centro hueco de los huesos, es la fuente principal de todas las células sanguíneas, incluyendo las células inmunes.

El timo es un órgano que se encuentra detrás del esternón; los linfocitos conocidos como linfocitos T, o simplemente como células T, maduran aquí.

El bazo es un órgano aplanado localizado en la parte superior izquierda del abdomen. Similar a los nódulos linfáticos, el bazo contiene compartimientos especializados en donde las células inmunes se reúnen y confrontan a los antígenos.

Además de estos órganos, se encuentran grupos de tejido linfoide en muchas partes del cuerpo, especialmente en los recubrimientos del tracto digestivo y de las vías aéreas y en los pulmones-los cuales son las entradas al cuerpo. Estos tejidos incluyen las amígdalas, las adenoides y el apéndice.